Hiç arkadaşı olmayan Shaggy'nin yolu Scooby Doo ile kesişir. Okul otobüsündeki kavga sonrasında Fred, Daphne ve Velma ile tanışırlar. Kütüphanede başlarından geçen garip olaylar sonucunda okuldan atılırlar. Masumiyetlerini kanıtlamak için Scooby-Doo ve ekibin geri kalanları kendilerini ilk gizemlerinin içinde bulurlar.